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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/399| Contribución a la caracterización molecular, citogenética, morfométrica y bioquímica del camarón de salmuera artemia de Cuba y Sur de México | |
| RAFAEL ANTONIO TIZOL CORREA | |
| GOPAL MURUGAN Alejandro Manuel Maeda Martínez | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Artemia franciscana; Bioquímica; Cuba | |
| Poblaciones de Artemia de salinas tropicales de América Central y el Caribe, provenientes de ocho localidades de México [Celestún (YCE), San Crisanto (YSC), Xtampú (YX) y Chuburna (YC), en Yucatán, Laguna La Colorada en Oaxaca (OX) y Real de Salinas en Campeche (CP)] y dos sitios de Cuba [salina El Real, Camagüey (CM) y Frank País, Guantánamo (CGA)], fueron evaluadas para determinar su posición sistemática y relaciones filogenéticas. Para ello se utilizaron análisis moleculares (secuencias de los genes 16S ribosomal ARN (16S ARNr) y citocromo oxidasa I (COI)), citogenéticos (número de cromocentros) y morfológicos. Además, se evaluaron características nutricionales de las poblaciones mencionadas a partir de estudios de la composición de ácidos grasos de los quistes y aspectos biométricos de quistes, nauplios y adultos de las poblaciones de Cuba de interés para la acuicultura. A partir del ADN total extraído de quistes decapsulados se amplificaron y secuenciaron los genes en estudio. Las secuencias se evaluaron usando los algoritmos de parsimonia máxima, máxima similitud, vecino más cercano, y análisis Bayesiano con el modelo TIM+I+G obtenido del Modeltest. En los análisis se incluyeron secuencias de los anostracos Artemia franciscana, A. persimilis, A. sinica, Parartemia contracta, P. cylindifera, Thamnocephalus platyurus, Streptocephalus dorothae, Artemiopsis stefanssoni, Eubrancihpus sp., Polyartemiella hazeni y Branchinecta paludosa. obtenidas del GenBank. Los análisis de vecino más cercano con evaluación de las distancias en máxima similitud, ,máxima parsimonia con búsqueda heurística, máxima similitud y el análisis Bayesiano indican que las poblaciones de Artemia forman un grupo monofilético (BS = 100%). Las poblaciones de Artemia de Cuba junto con A. franciscana forman un grupo hermano (BS = 100%) con las poblaciones de Artemia de México. Se reporta por primera vez la obtención de cromocentros a partir de quistes. Se evaluaron dos poblaciones de Cuba, tres poblaciones del sur de México [San Crisanto, Yucatán, (YSC), Lagunas La Colorada en Oaxaca (OX) y Real de Salinas en Campeche (CP)] y dos poblaciones de referencia: Puerto Rico y Estados Unidos. Se compararon las medias obtenidas con otras provenientes de la bibliografía pertenecientes a 19 poblaciones de Artemia franciscana y A. persimilis de diferentes localidades de América a través del análisis discriminante con relación completa y distancias euclidianas [...] Geographically separated Artemia populations from tropical salterns of Central America and the Caribbean, four sites in the Yucatán Peninsula [Celestún (YCE), San Crisanto (YSC), Xtampú (YX), and Chuburna YC)], one site each in the states of Oaxaca (Laguna La Colorada) (OX) and Campeche (Real de Salinas) (CP), México, and two sites Camagüey (El Real) (CM) and Guantánamo (Frank País) (CGA) in Cuba, were examined to determine their phylogenetic relationships and systematic position, using molecular (sequences of the 16S ribosomal RNA (16S rRNA) and cytochrome oxidase I (COI) genes), cytogenetic (number of chromocenter) and morphologic analysis. Aspects like fatty acid profile and biometrics (cyst, nauplii and adults) that are interesting for aquaculture were also analyzed. From the total DNA extracted from decapsulated cysts of Artemia, fragments of the mitochondrial genes 16S rRNA and cytochrome oxidase I were amplified and sequenced. These sequences were phylogenetically analysed using the Maximum Parsimony, Maximum Likelihood, Neighbour Joining, and Bayesian algorithms with the DNA evolution model obtained by Modeltest. Additional GenBank sequences of the anostracans Artemia franciscana, A. persimilis, A. sinica, Parartemia contracta, P. cylindifera, Thamnocephalus platyurus, Streptocephalus dorothae, Artemiopsis stefanssoni, Eubrancihpus sp., Polyartemiella hazeni and Branchinecta paludosa were included in the analyses. The Neighbour Joining analysis with distance measurement set to maximum likelihood, Maximum Parsimony analysis with heuristic search, Maximum likelihood analysis, and Bayesian inference analyses revealed the Artemia populations as a monophyletic group (BS = 100%). However, Artemia populations from Cuba together with A. franciscana formed a sister group to Mexican Artemia (BS = 100%). For cytogenetic analysis decapsulated cyst were used for two Cuban populations, three Mexican populations [San Crisanto, Yucatan (YSC), Laguna La Colorada, Oaxaca (OX) and Real de Salinas en Campeche (CP)] and one locality each from United Status and Puerto Rico as reference. Average chromocenter numbers were compared with information from 19 populations of Artemia franciscana and A. persimilis using complete linkage and Euclidean distances [...] | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | |
| 23-05-2006 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| GENÉTICA BIOQUÍMICA | |
| Versión publicada | |
| publishedVersion - Versión publicada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| tizol_r.pdf | Tesis de Rafael Antonio Tizol Correa | 741.35 kB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |