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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/3025| Diversidad genómica de los corales escleractíneos Agaricia agaricites, Montastraea cavernosa y Siderastrea siderea del Caribe Mexicano | |
| David Antonio Lopez Villarreal | |
| Fausto Valenzuela Quiñonez DAVID ARTURO PAZ GARCIA | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Diversidad genómica, ddRad-seq, corales pétreos, Caribe Mexicano, linajes crípticos Genomic diversity, ddRad-seq, stony corals, Mexican Caribbean, cryptic lineages | |
| "Los corales escleractinios son organismos de importancia biológica por la capacidad de formar arrecifes que brindan hábitat a una gran variedad de organismos. Esta característica confiere la cualidad de formar ecosistemas sumamente diversos, en donde se crían y viven diversas especies de interés comercial. Actualmente, existe una disminución en las poblaciones y en la diversidad en los corales pétreos debido al estrés generado por actividades antropogénicas. El estudio de la diversidad genética nos permite tener una idea del potencial adaptativo de las poblaciones ante futuros cambios ambientales. El objetivo de este estudio es analizar la diversidad y estructuración genómica de los corales escleractinios Agaricia agaricites, Montastraea cavernosa y Siderastrea siderea de la región del Caribe Mexicano mediante la técnica de secuenciación de ADN asociadas a sitios de restricción de doble digestión (ddRAD-seq). Con el fin de lograr este objetivo, se secuenciaron 68 colonias de S. siderea, 42 de A. agaricites y 24 de M. cavernosa, pertenecientes a 5 localidades distintas pertenecientes al Caribe Mexicano. Debido a la integridad del ADN, los análisis de M. cavernosa no pudieron ser realizados. El número de colonias útiles, se redujo a 41 para S. siderea y 24 para A. agaricites. Se obtuvieron 4,047 SNP´s neutrales pertenecientes a S. siderea y 405 SNP´s para A. agaricites. No se encontraron evidencias de divergencia poblacional espacial evidente para ambas especies. Sin embargo, se encontró evidencia de linajes crípticos al interior de ambas especies. Los resultados arrojaron la presencia de 2 linajes crípticos simpátricos pertenecientes a S. siderea, (Fst = 0.308; P < 0.001), mientras que los linajes encontrados al interior de A. agaricites fueron alopátricos (Fst = 0.146; P < 0.001). Tres de los cuatro linajes encontrados en ambas especies presentaron señales de endogamia, con un coeficiente de consanguinidad poblacional (Fis) de 0.15-0.19. Ninguno de los linajes encontrados para ambas especies fue particularmente más susceptible a contraer la enfermedad de pérdida de tejido de corales pétreos. Los resultados de este trabajo se suman a las recientes evidencias que señalan la presencia de linajes crípticos al interior de corales escleractinios a nivel mundial. Por lo cual, para llegar a comprender los patrones de estructuración genética al interior de este grupo, es necesario continuar con este tipo de esfuerzos de investigación." "Scleractinian corals are biologically important due to their ability to form reefs that provide habitat for diverse species. This characteristic allows them to create highly diverse ecosystems, where numerous commercially important species live and reproduce. Currently, populations and diversity of stony corals are declining due to stress caused by anthropogenic activities. The study of genetic diversity provides insight into the adaptive potential of populations in the face of future environmental changes. This study aims to analyze the genomic diversity and structure of the scleractinian corals Siderastrea siderea, Agaricia agaricites, and Montastraea cavernosa from the Mexican Caribbean region. The analysis used the double-digest restriction site-associated DNA sequencing (ddRAD-seq) technique. To achieve this goal, 68 colonies of S. siderea, 42 of A. agaricites, and 24 of M. cavernosa from five different localities in the Mexican Caribbean were sequenced. However, analyses of M. cavernosa could not be performed due to insufficient DNA integrity. The number of usable colonies was reduced to 41 for S. siderea and 24 for A. agaricites. 4,047 neutral SNPs were obtained for S. siderea and 405 SNPs for A. agaricites. Spatial population structure methods did not detect evidence of population divergence. However, there is evidence of cryptic lineages within both species. The results revealed the presence of two sympatric cryptic lineages in S. siderea (Fst = 0.308; P < 0.001), while the lineages identified within A. agaricites were allopatric (Fst = 0.146, P < 0.001). Three of the four lineages found in both species showed signs of inbreeding, with a population inbreeding coefficient (Fis) ranging from 0.15 to 0.19. None of the lineages identified for either species demonstrated significant susceptibility to contracting stony coral tissue loss disease. These findings contribute to the growing body of evidence highlighting the global presence of cryptic lineages within scleractinian corals. Therefore, it is essential to continue such research efforts to understand the patterns of genetic structuring within this group." | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. | |
| 2024 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| GENÉTICA ANIMAL | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| lopez_d TESIS.pdf | Tesis de Maestría de David Antonio López Villarreal | 1.77 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |