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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/2985| Caracterización de los genes de virulencia y resistencia a antibióticos de Vibrio sp. de diferentes granjas de cultivo | |
| LAURA ELENA COTA ORTEGA | |
| Eduardo Quiroz Guzmán Jose Luis Balcazar | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| "La acuicultura ha experimentado un crecimiento acelerado en los últimos años, pero la camaronicultura a gran escala ha estado vinculada a problemas ambientales y enfermedades, especialmente en cultivos intensivos. Por ello, el objetivo principal del estudio es comprender los mecanismos de transferencia, así como identificar y caracterizar los genes asociados a la virulencia y resistencia antimicrobiana en Vibrio sp. desarrollando herramientas y estrategias de identificación y resolución de problemas relacionados con enfermedades patógenas en acuicultura. En este estudio, se aislaron 10 cepas de Vibrio sp. de sistemas de cultivo de Paeus vannamei que mostraban signos de vibriosis, seleccionando 6 cepas resistentes a antibióticos para pruebas adicionales. Las pruebas de susceptibilidad antibiótica revelaron una variabilidad significativa en la resistencia entre las cepas; la cepa T13P mostró una marcada resistencia a la oxitetraciclina (MIC de 256 µg/ml), mientras que la cepa T25 mostró resistencias elevadas al florfenicol (512 µg/ml) y la furazolidona (128 µg/ml). El análisis genómico basado en el gen 16S rRNA identificó una cepa como V. parahaemolyticus (T13P) y cinco cepas como V. diabolicus (T13N, T25P, T35, T63, T63N). Los análisis de hibridación y comparación genómica mostraron una alta similitud entre las cepas de la misma especie, mientras que el ensamblaje genómico con A5 generó mejores resultados en cuanto al número y longitud de los contigs. Los mapas genómicos revelaron la presencia de diversos genes de resistencia a antibióticos, como el vanT-vanG cluster, vanY-vanB cluster, tet(35), TxR, blaCARB-42, blaCARB-18, rsmA, adeF, CRP, tet(B) y tetR. Además, se identificó un plásmido en la cepa T13P con genes de virulencia y resistencia, con alta similitud a plásmidos de otras cepas del género Vibrio. El análisis de profagos mostró la presencia de fagos en la mayoría de las cepas, excepto en T35 y T13N. Los análisis de tipificación multilocus de secuencias (MLST) revelaron relaciones genéticas cercanas entre las cepas mexicanas y cepas de origen chino y asiático, independientemente de la especie analizada. "
"Aquaculture has experienced rapid growth in recent years, but large-scale shrimp farming has become associated with environmental problems and diseases, especially in intensive farming. The main objectives of this study are to understand the mechanisms of transfer, as well as to identify and characterize genes associated with virulence and antimicrobial resistance in Vibrio sp., and to develop tools and strategies for the identification and resolution of issues related to pathogenic diseases in aquaculture. In this study, ten strains of Vibrio sp. were isolated from Penaeus vannamei culture systems showing signs of vibriosis, with six antibiotic-resistant strains selected for further testing. Antibiotic susceptibility tests revealed significant variability in resistance among the strains, with strain T13P showing marked resistance to oxytetracycline (MIC of 256 µg/ml), while strain T25 exhibited high resistance to florfenicol (512 µg/ml) and furazolidone (128 µg/ml). Genomic analysis based on the 16S rRNA gene identified one strain as V. parahaemolyticus (T13P) and five strains as V. diabolicus (T13N, T25P, T35, T63, T63N). Hybridization and genomic analyses showed high similarity among strains of the same species, whole genome assembly using A5 yielded better results in terms of contig number and length. Genomic mapping revealed the presence of various antibiotic resistance genes, such as the vanT-vanG cluster, vanY-vanB cluster, tet(35), TxR, blaCARB-42, blaCARB-18, rsmA, adeF, CRP, tet(B), and tetR. Additionally, a plasmid carrying virulence and resistance genes was identified in strain T13P, showing high similarity to plasmids found in other Vibrio strains. Prophage analysis indicated the presence of phages in most strains, except T35 and T13N. Multilocus sequence typing (MLST) analysis revealed close genetic relationships between Mexican strains and strains of Chinese and Asian origin, irrespective of the species analyzed." | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. | |
| 2024 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| BIOLOGÍA Y QUÍMICA | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| cota_l TESIS.pdf | tesis de Laura Elena Cota Ortega | 1.31 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |