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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/2777| Variación genética e impacto de los eventos geoclimáticos en el cirio (Fouquieria columnaris) | |
| JOSUE JACOB MARTINEZ NOGUEZ | |
| FRANCISCO JAVIER GARCIA DE LEON | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| cirio, Fouquieria columnaris, SNPs, ADN cloroplástico, modelación de nicho, genética poblacional, filogeografía, Desierto de Sonora cirio, Fouquieria columnaris, chloroplast DNA, niche modeling, population genetics, phylogeography, Sonoran Desert | |
| "Para fundamentar estrategias de manejo y conservación de la biodiversidad es importante comprender la historia filogeográfica, identificar y delimitar espacialmente poblaciones genéticamente distintas y comprender su grado de conectividad, así como su capacidad para responder a eventos de cambio climático actuales y futuros. En el presente estudio se emplearon distintas aproximaciones para estimar la diversidad, la estructura genética y el impacto de escenarios climáticos históricos a lo largo de la distribución geográfica del cirio (Fouquieria columnaris): 1) Con una perspectiva filogeográfica y empleando espaciadores intergénicos de ADN cloroplásticos (ADNcp) se detectaron cuatro linajes, Norte peninsular, San Francisco de la Sierra, el complejo volcánico Tres Vírgenes y la localidad continental de Sierra Bacha, estos linajes divergieron por barreras vicariantes; además, la especie redujo su distribución a áreas de refugios durante el Último Máximo Glacial (UMG). 2) Mediante métodos genómicos se generaron 1,137 SNPs (polimorfismos de un solo nucleótido) neutrales en individuos de los cuatro linajes previamente detectados con ADNcp, con esta variación del ADN nuclear neutral se identificaron cuatro poblaciones, Norte, Central, Tres Vírgenes, y Sierra Bacha. Además, con esta información genética se detectaron patrones de diversidad asociados con cuellos de botella históricos para la especie y eventos de flujo génico asimétrico desde Sierra Bacha hacia la población Norte. En el área peninsular se encontró un patrón de aislamiento por distancia (r = 0.816). 3) Se detectaron eventos de contracción en el área de distribución del cirio durante el UMG mediante el uso de modelación de nicho al pasado y se identificaron los posibles sitios que funcionaron como refugio durante el Holoceno, donde la especie comenzaría a ocupar el área de distribución actual. En las modelaciones del presente se definió la amplitud y diferenciación del nicho entre poblaciones genéticas detectadas con la variación del ADN nuclear neutral. Estas se proyectaron al futuro, observándose una persistencia en los hábitats para Tres Vírgenes y Sierra Bacha, pero una importante reducción del hábitat para las poblaciones Norte y Central. Ninguno de estos rasgos poblacionales había sido descrito para la especie, por lo que esta información debería auxiliar a las estrategias futuras de conservación para evitar la pérdida de la biodiversidad en esta icónica especie." "To support biodiversity management and conservation strategies, it is important to understand the phylogeographic history, identify and spatially delimit genetically distinct populations, and understand their degree of connectivity, as well as their ability to respond to current and future climate change events. In the present study, different approaches were used to estimate the diversity, the genetic structure, and the impact of historical climatic scenarios throughout the geographic distribution of the cirio (Fouquieria columnaris): 1) With a phylogeographic perspective and using chloroplast DNA intergenic spacers (cpDNA) four lineages were detected, the North of the peninsula, San Francisco de la Sierra, the Tres Vírgenes volcanic complex and the continental locality of Sierra Bacha. These lineages diverged by vicariant barriers; In addition, the species reduced its distribution to refuge areas during the Last Glacial Maximum (LGM). 2) Using genomic methods, 1,137 neutral SNPs (single nucleotide polymorphisms) were generated in individuals of the four lineages previously detected with cpDNA, with this variation of neutral nuclear DNA four populations were identified: North, Central, Tres Vírgenes, and Sierra Bacha. In addition, with this genetic information, patterns of diversity associated with historical bottlenecks and an asymmetric gene flow from Sierra Bacha to the North population were detected. In the peninsular area, a pattern of isolation by distance was found (r = 0.816). 3) Contraction events in the distribution area of the cirio during the LGM were detected using past niche modeling and the possible sites that functioned as a refuge during the Holocene were identified, where the species would begin to occupy the distribution area. current. In the modeling of the present, the amplitude and differentiation of the niche between genetic populations detected with the variation of the neutral nuclear DNA were defined. These were projected into the future, observing a persistence in the habitats for Tres Vírgenes and Sierra Bacha, but an important reduction of the habitat for the North and Central populations. None of these population traits had been described for the species, so this information should help future conservation strategies to prevent the loss of biodiversity in this iconic species." | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. | |
| 2023 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| GENÉTICA VEGETAL | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| martinez_j TESIS.pdf | Tesis de Josué Jacob Martínez Noguez | 5.01 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |