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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/2711| Conservation of cis-regulatory elements in maize Dof01 promoter: a key regulator of the cold stress response Elementos regulatorios cis conservados en el promotor Dof01 de maíz: regulador clave de la respuesta a estrés por frío | |
| HECTOR DANIEL GARZA AVELAR AXEL TIESSEN FAVIER LUIS RAFAEL HERRERA ESTRELLA Felipe de Jesús Ascencio Valle CESAR SALVADOR CARDONA FELIX GRACIA ALICIA GOMEZ ANDURO | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| DOI: https://doi.org/10.29267/mxjb.2020.5.2.135 ISSN: 2448-6590 URL: https://www.mexjbiotechnol.com/_files/ugd/38ce56_5a6903ac91f045c88d66f46fdbb713aa.pdf | |
| Dof, elementos regulatorios cis, factores de transcripción, promotor, sitio de inicio de la transcripción, sitio de unión a factores de transcripción cis-regulatory elements, promoter, transcription factors, transcription factor binding sites, transcription start site | |
| "Gene expression patterns are controlled by cis regulatory elements (CRE) present in promoters. To understand how CRE are responsible for transcriptional activity and shape the architecture of a promoter, it is necessary to identify them and associate them with specific responses. Comparative studies of Dof promoters have focused on analyzing these sequences in different species. However, it is unknown how CRE are conserved among different varieties of the same species. In this work, a comparative analysis of the Dof01 gene promoter sequences of five varieties of maize (Zea mays) (B73, Palomero Toluqueño, Teosinte, W22 and Mo17) was performed to understand the architecture of the Dof01 promoter. Sequence analysis shows that there is a 179 bp indel element that is present in the B73 Dof01 promoter but absent in the other four varieties. Also, highly conserved CRE can be identified and may be related to the response to low temperatures. Therefore, we analyzed the expression of the Dof01 gene in B73 and Palomero under conditions of stress from low (4°C) and high (42°C) temperature. The expression data considered that the Palomero Dof01 gene is over-expressed with respect to the control due to the cold response. This work is the first step for the functional characterization of the Dof01 gene promoter to identify the regulatory elements associated with the temperature stress response and obtain the minimum promoter necessary for transcriptional regulation." "Los patrones de expresión de genes son controlados por elementos regulatorios cis (CRE) presentes en los promotores. Para entender cómo los CRE son responsables de la actividad transcripcional y forman la arquitectura de un promotor, es necesario identificarlos y asociarlos a respuestas específicas. Los estudios comparativos de promotores Dof se han enfocado en analizar estas secuencias en diferentes especies. Sin embargo, se desconoce cómo los CRE son conservados entre diferentes variedades de una misma especie. En este trabajo se realizó un análisis comparativo de las secuencias del promotor del gen Dof01 de cinco variedades de maíz (Zea mays) (B73, Palomero Toluqueño, Teosinte, W22 y Mo17) para entender la arquitectura del promotor Dof01. El análisis de secuencias mostró que hay un elemento de inserción/deleción de 179 pb que está presente en el promotor Dof01 de B73 pero ausente en las otras cuatro variedades. También, se identificaron CRE altamente conservados y que pueden estar relacionados con la respuesta a bajas temperaturas. Por eso, se analizó la expresión del gen Dof01 en B73 y Palomero bajo condiciones de estrés por baja (4°C) y alta (42°C) temperatura. Los datos de expresión mostraron que el gen Dof01 de Palomero se sobre expresa con respecto al control debido a la respuesta 137 a frío. Este trabajo es el primer paso para la caracterización funcional del promotor del gen Dof01 para identificar los elementos regulatorios asociados con la respuesta a estrés por temperatura y obtener el promotor mínimo necesario para regular la transcripción." | |
| Universidad Autonoma de Tlaxcala | |
| 2020 | |
| Artículo | |
| Mexican Journal of Biotechnology | |
| Español | |
| GENÉTICA VEGETAL | |
| Versión publicada | |
| publishedVersion - Versión publicada | |
| Aparece en las colecciones: | Artículos |
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| Conservation of cis-regulatory elements in maize Dof01 promoter a key regulator of the cold stress response.pdf | 87.46 kB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |