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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/2683| Estructura genética de Dipsosaurus dorsalis (Baird y Girard, 1852) en la Península de Baja California. Un estudio comparando secuencias de ADN mitocondrial y loci microsatélites | |
| Víctor Manuel Arano Sierra | |
| FRANCISCO JAVIER GARCIA DE LEON | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| ADN mitocondrial, filogeografía, estructura genética, discordancia mitonuclear, tiempos de divergencia Mitochondrial DNA, phylogeography, genetic structure, mitonuclear discordance, divergence times | |
| "La filogeografía es una rama de la genética de poblaciones que permite comprender los patrones de variación y distribución de los alelos y haplotipos dentro y entre las diferentes especies, para así poder explicar los fenómenos evolutivos e impulsar mejores acciones de manejo ambiental que promuevan la conservación de la biodiversidad. A pesar de los esfuerzos por esclarecer la filogeografía del “cachorón güero” (Dipsosaurus dorsalis), aún se desconoce si la conformación de su estructura genética actual se consolidó en tiempos recientes, o si su divergencia es más antigua. En este estudio se utilizó un set de datos microsatélites (publicado anteriormente) y dos fragmentos del ADN mitocondrial (ADNmt) para analizar la estructura genética de D. dorsalis en la Península de Baja California (PBC) y determinar si ambos marcadores presentan la misma señal filogeográfica o si presentan discordancia mitonuclear, y en este caso explicar sus causas. Para ello se extrajo el ADN de 155 individuos de la especie D. dorsalis y se amplificó mediante PCR los fragmentos de los genes mitocondriales Citocromo Oxidasa Subunidad I y Citocromo B. A partir de los análisis de estructura poblacional se identificaron tres linajes: Península Centro – Sur (PCS); Península Norte (PN); Estados Unidos y Sonora (EUS). A partir del análisis de los tiempos de divergencia se determinó que la especie parece haber sufrido dos importantes eventos divergentes, el primero de ellos ocurrió ~ 31 – 295 mil años y separó al linaje más norteño (EUS). El segundo evento parece haber fragmentado a los linajes del interior de la PBC en dos (PN y PCS) ocurrió hace ~ 9 – 76 mil años. Dichos eventos se ven apoyados por el análisis de demografía histórica ya que D. dorsalis parece haber adquirido su estructura poblacional de manera reciente (~ 260 mil) después de un largo periodo de estabilidad (~ 640 mil). Finalmente, los patrones de estructura genética poblacional de los marcadores mitocondriales y nucleares no son conclusivos con respecto a un patrón de discordancia mitonuclear. Se propone que las oscilaciones climáticas ocurridas durante el Pleistoceno en conjunto con la heterogeneidad del paisaje, pudieron tener una gran influencia en la conformación de la estructura genética actual de la especie." "Phylogeography is a branch of population genetics that allows us to understand the patterns of variation and distribution of alleles and haplotypes within and between different species, to explain evolutionary phenomena and promote better environmental management actions that promote the conservation of biodiversity. Despite efforts to clarify the phylogeography of the "cachorón güero" (Dipsosaurus dorsalis), it is still unknown whether the conformation of its current genetic structure was consolidated in recent times, or whether its divergence is older. This study used a microsatellite data set (previously published) and two mitochondrial DNA fragments (mtDNA) to analyze the genetic structure of D. dorsalis in the Baja California Peninsula (BCP) and determine whether both markers present the same phylogeographic signal or whether they present mitonuclear discordance, and in this case explain their causes. DNA was extracted from 155 individuals of the species D. dorsalis and the fragments of the mitochondrial genes Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) and Cytochrome B (CytB) were amplified by PCR. Three lineages were identified from population structure analyses: South – Central Peninsula (SCP); North Peninsula (NP); United States and Sonora (USS). From the analysis of divergence times, it was determined that the species appears to have suffered two important divergent events, the first of which occurred ~ 31 - 295 thousand years and separated the northernmost lineage (USS). The second event seems to have fragmented the inner lineages of the BCP into two (NP and SCP) occurred ~ 9 - 76 thousand years ago. Such events are supported by historical demographic analysis as D. dorsalis appears to have recently acquired its population structure (~ 260 thousand years) after a long period of stability (~ 640 thousand years). Finally, population genetic structure patterns of mitochondrial and nuclear markers are not conclusive with respect to a mitonuclear discordance pattern. It is proposed that the climatic oscillations that occurred during the Pleistocene along with the heterogeneity of the landscape, could have a great influence on the conformation of the current genetic structure of the species." | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | |
| 2022 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| GENÉTICA ANIMAL | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| arano_v TESIS.pdf | Tesis de Víctor Manuel Arano Sierra | 2.15 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |