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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/2447| Genes de respuesta a estrés térmico regulados por metilación en el ostión del Pacífico Crassostrea gigas | |
| Roberto Carlos Arredondo | |
| Ana María Ibarra Humphries Cristina Escobedo Fregoso | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Treanscriptómica, Epigenética, expresión diferencial, metilación de ADN, fenotipos térmicos, acuicultura Transcriptomic, Epigenetic, Differential expression, DNA methylation, thermal-phenotypes, aquaculture | |
| "Desde la introducción del ostión del Pacífico Crassostrea gigas en Baja California Sur, México, su cultivo ha enfrentado retos ambientales específicamente con el aumento de temperatura, produciendo altas mortalidades. El cambio en el medio ambiente relacionado a la temperatura durante un año en la Península de Baja California oscila entre los 7°C y los 39°C. En esta área, el estrés por calor es uno de los factores que afectan la producción del ostión del Pacífico, por lo cual se requieren investigaciones destinadas a mejorar la tolerancia al aumento de temperatura. Por esta razón, se está implementando el cultivo de C. gigas, para mejoramiento genético, donde se han caracterizado las líneas de cría disponibles con 50 familias. Dada su tolerancia al calor, se seleccionaron las dos más termo-resistentes y las dos más termo-susceptibles. Asimismo, con base en monitoreo de lugares de cultivo como la Laguna San Ignacio B.C.S., las familias fueron expuestas a un reto térmico oscilatorio (26°C - 34°C) durante 30 días. Se tomaron muestras de tejido de branquia con el objetivo de analizar las diferencias en la expresión génica y la metilación del ADN entre los fenotipos resistentes y susceptibles. La expresión génica reveló 1,182 transcritos sobre-reguladas y 2,002 sub-regulados en el día 0 y 2,660 genes sobre-regulados y 2,172 sub-regulados en el día 30. Los genes sobre-regulados se relacionaron con procesos celulares, la actividad de unión y partes de la membrana. Además, se observaron 170 transcritos expresadas diferencialmente en termo-resistentes y 170 en termo-susceptibles conservados durante el reto térmico. Estos transcritos se sugirieron como transcritos marcadores para la diferenciación entre fenotipos.
En el análisis de metilación del ADN, no se encontraron diferencias en la metilación global entre los fenotipos. Sin embargo, se encontraron regiones metiladas diferencialmente (DMR) entre los fenotipos, lo que sugiere que la temperatura modifica la metilación en regiones génicas de C. gigas, donde los termo-resistentes mostraron más genes con hiper-DMR en intrones (122), seguidos de exones (23) y promotores (2), mientras que las regiones hipometiladas correspondían a diez en intrones, tres en exones y uno en promotor. Los DMR hipermetilados se encontraron principalmente en genes asociados con procesos como la regulación de la expresión génica, interacción de iones, metabolismo y la producción de componentes celulares..." "Since the introduction of the Pacific oyster Crassostrea gigas in Baja California Sur, Mexico, Its culture has faced environmental challenges specifically with increasing of temperatures producing high mortalities. The environmental criteria about temperature during a year in the Baja California Peninsula oscillates from 7°C to 39°C. In this area, heat stress is one of the factors that affect production of the Pacific oyster and research aiming to improve heat tolerance is required. For this reason, C. gigas breeding stock, produced for genetic improvement, has been implemented, and breeding lines available with 50 families were characterized for their heat-tolerance, selecting the two-most heat-resistant and the two-most heat-susceptible families. Based on culture place observations as San Ignacio Lagoon B.C.S., the families were exposed to an oscillatory thermal challenge (26-34°C) during 30 days. Gill tissue was sampled and aimed for analyzing for differences in gene expression and DNA methylation among heat-resistant and heat-susceptible phenotypes. Gene expression reveled 1,182 up and 2,002 down regulated transcripts at day 0 and 2,660 up and 2,172 down regulated genes at day 30. The up regulated genes involved in cellular processes, binding activity and parts of membrane were mostly present. Additionally, in RR there were 170 differential expressed transcripts in thermal-resistants and 170 in thermal-susceptible conserved during the thermal challenge. These transcripts were suggested as transcript markers for phenotype differentiation. In DNA methylation differences were found in global methylation among heat-phenotypes, differentially methylated regions (DMRs) were found among phenotypes, suggesting that temperature modifies the methylation in gene bodies of C. gigas, where the heat-resistants showed more genes with hyper-methylated DMRs in introns (122), followed by exons (23), and promoters (2), whereas hypo-methylated regions corresponded to ten in introns, three in exons, and one in promoters. Hyper-methylated DMRs were mostly found in genes associated with processes such as regulation of gene expression, ions interactions, metabolism, and production of cellular components. In other instance, the comparison of gene expression and methylation reports did not present a correlation between gene expression results and DMRs..." | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | |
| 2021 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| REPRODUCCIÓN | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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