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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/2015| ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS SECUENCIAS DE PROMOTORES DE LA FAMILIA DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN DOF EN MAÍZ | |
| HECTOR DANIEL GARZA AVELAR | |
| GRACIA ALICIA GOMEZ ANDURO LUIS RAFAEL HERRERA ESTRELLA | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Factor de transcripción, Promotor, Maíz, Domesticación Transcription Factor, Promoter, Maize, Domestication | |
| "Uno de los principales mecanismos por los cuales un organismo sufre cambios fenotípicos es la modificación en las secuencias de ADN encargadas de regular la expresión de genes. Durante el proceso de domesticación del maíz, la mano del hombre influyó en la selección de genes y secuencias de promotores que han sido conservados y que pueden estar relacionados a la adaptabilidad de las plantas a diferentes condiciones. Por eso, es necesario identificar qué elementos regulatorios han sido conservados entre variedades silvestres y actuales. En el presente trabajo realizamos un análisis comparativo de las secuencias de promotores que regulan la expresión de la familia de factores de transcripción Dof en Maíz. Para eso, seleccionamos al ancestro silvestre del maíz actual, el Teosinte, a la raza ancestral de Palomero Toluqueño y a un maíz actual, B73. Se determinó la arquitectura de los promotores Dof y se identificaron los elementos regulatorios presentes a lo largo de las secuencias. También, se realizó un análisis de expresión del gen Dof01 de maíz Palomero bajo condiciones de estrés por temperatura baja y alta (4°C y 42°C, respectivamente), comparando los resultados contra datos de expresión de maíz B73 dispuestos en bases de datos. En ellas identificamos los elementos regulatorios cis responsables de la arquitectura del promotor, a qué familias de factores de transcripción pertenecen y los perfiles de expresión espacio-temporal de los mismos. Realizamos un análisis de correlación para identificar los factores de transcripción que regulan la expresión del gen Dof01. El análisis de secuencias mostró que hay un elemento de inserción/deleción de 179 pb que está presente en el promotor Dof01 de B73, pero ausente en las secuencias de las otras dos variedades. Además, identificamos los elementos regulatorios cis que pueden estar relacionados a la respuesta a bajas temperaturas. El análisis comparativo de las secuencias del promotor Dof01 mostró que los elementos regulatorios están altamente conservados. Sin embargo, algunos sitios de unión a factores de transcripción presentes en el promotor de Teosinte no se encuentran en B73 y viceversa. Por otra parte, los datos de expresión del gen Dof01 de PAL muestran una sobreexpresión con respecto al control debido a la respuesta a frío, mientras que los datos de expresión del gen Dof01 de B73 muestran que este gen se reprime con respecto al control..." "One of the main mechanisms by which an organism undergoes phenotypic changes is the modification in the DNA sequences responsible for regulating the expression of genes. During the domestication process of maize, the hand of man influenced the selection of genes and promoter sequences that have been conserved and that may be related to the adaptability of plants to different conditions. For this reason, it is necessary to identify which regulatory elements have been conserved between wild and current varieties. In the present work we carry out a comparative analysis of the promoter sequences that regulate the expression of the Dof family of transcription factors in Corn. For that, we selected the wild ancestor of current maize, Teosinte, the ancestral race of Palomero Toluqueño and a current maize, B73. The architecture of the Dof promoters was determined and the regulatory elements present throughout the sequences were identified. Also, an expression analysis of the Dof01 gene of Palomero maize was performed under conditions of stress due to low and high temperature (4°C and 42°C, respectively), comparing the results against the expression data of B73 maize arranged in databases. In them we identify the cis-regulatory elements responsible for the promoter architecture, which families of transcription factors they belong to, and their spatio-temporal expression profiles. We performed a correlation analysis to identify the transcription factors that regulate the expression of the Dof01 gene. Also, we compared the expression data of the Dof01 gene taken from the B73 maize expression atlas under the same temperature stress conditions. Sequence analysis showed that there is a 179 bp insertion / deletion element that is present in the Dof01 promoter of B73, but absent in the sequences of the other two varieties. In addition, we identify the cis regulatory elements that may be related to the response to low temperatures. The comparative analysis of the sequences of the Dof01 promoter showed that the regulatory elements are highly conserved. However, some transcription factor binding sites present in the Teosinte promoter are not found in B73 and vice versa. On the other hand, the expression data of the PAL Dof01 gene show overexpression with respect to the control due to the response to cold, while the expression data of the B73 Dof01 gene show that this gene is repressed with respect to the control..." | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. | |
| 2020-09 | |
| Tesis de doctorado | |
| Español | |
| GENÉTICA VEGETAL | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| garza_h TESIS.pdf | Tesis de Héctor Daniel Garza Avelar | 4.37 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |