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ESTRUCTURA GENÓMICA POBLACIONAL DEL CAMARÓN AZUL (Litopenaeus stylirostris) EN LA COSTA NOROESTE DE MÉXICO
JUAN PAULO MORA MARTINEZ
Fausto Valenzuela Quiñonez
NORMA YOLANDA HERNANDEZ SAAVEDRA
Acceso Abierto
Atribución-NoComercial-SinDerivadas
SNPs, genómica poblacional, ddRAD-seq, stocks poblacionales, Litopenaeus stylirostris
population genomics, population stocks
"El adecuado manejo pesquero depende, en gran medida, de la correcta identificación de los stocks pesqueros. La delimitación de estos grupos nos permite evaluar sus dinámicas particulares con diferentes respuestas a la presión pesquera y/o ambiental; por lo que su delimitación espacial debe ser primordial en la gestión de los recursos pesqueros. La genómica poblacional permite definir stocks poblacionales con mayor precisión debido al elevado número de loci analizados. El camarón azul (Litopenaeus stylirostris) es el recurso pesquero que representa la mayor fuente de ingresos económicos de la pesquería artesanal de los estados de Baja California Sur, Sonora y Sinaloa, reportando un estatus de aprovechamiento al máximo sostenible. Sin embargo, aún no se cuenta con un plan de manejo debido a la falta de delimitación espacial de potenciales stocks en la región. El objetivo de este trabajo fue identificar los stocks poblacionales de L. stylirostris en la costa noroeste de México. Para ello, se colectaron 330 individuos adultos de la pesca artesanal de 10 localidades del Golfo de California y una localidad del océano Pacifico. Se analizaron 755 loci polimorfismos de una sola base (SNPs, por sus siglas en inglés) mediante la técnica de secuenciación del ADN asociado a sitios de restricción de doble digestión (ddRAD-seq, por sus siglas en inglés). Del total de SNPs, 691 fueron identificados como loci neutrales y 6 como loci outliers. Los resultados de estructura poblacional mostraron para ambos grupos de loci, dos grupos poblacionales: uno integrado por la localidad de Bahía San Jorge (localidad del Alto Golfo de California) y el segundo integrado por el resto de las localidades desde Bahía de Kino (Sonora) hasta Altata (Sinaloa) por la parte continental y Puerto San Carlos (B.C.S.), lo cual difiere de las zonas administrativas actuales del recurso. Aunado al patrón de estructura, se observó un patrón de aislamiento por distancia significativo en marcadores neutrales. Estos patrones de estructura y flujo genético podría estar asociados a las corrientes oceanográficas, las cuales actúan como barreras geográficas y/o dispersión larvaria. Finalmente, no se encontró una asociación-genoma ambiente ni homología asociada a funciones biológicas para los 6 loci outliers."
"The suitable fisheries management depends on the correct identification of fisheries stocks. Delimitation of these groups enable to assess the particular population dynamics of each group, which presents different responses to fishery and/or environmental conditions. Therefore, the correct spatial delimitation should be essential in the management of fishery resources. Population genomics allows the accurate definition of population structure (stocks) using a high number of polymorphic loci. The blue shrimp (Litopenaeus stylirostris) fishery represents the largest source of income of the artisanal fishery in Baja California Sur, Sonora and Sinaloa, reporting a status of maximum sustainable yield. However, the fishery has not a management plan and lacks of knowledge about stocks composition in the region. The goal was identify the population stocks of L. stylirostris on the northwest coast of Mexico. A total of 330 adult individuals were collected from artisanal fishery, from 10 locations in the Gulf of California and a Pacific Ocean location. A total of 755 single nucleotide polymorphisms (SNPs) loci were obtained by DNA sequencing technique of double digest restriction-site associated DNA (ddRAD-seq). 691 SNPs were identified as neutral loci and 6 as outlier loci. Results of population structure showed two population groups using neutral and outlier loci: one located in San Jorge Bay (the Upper Gulf of California), and the second located from Bahia de Kino (Sonora) to Altata (Sinaloa), including Puerto San Carlos (BCS) in the mainland. These results differ from the current administrative areas of the blue shrimp. In addition, isolation by distance pattern was observed with neutral markers. The structure and gene glow patterns might be related with the oceanographic currents, which acting as geographical barriers and/or mechanisms of larval dispersion. Finally, no genome-environment association or homology associated with biological functions were found with the 6 outlier loci."
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C.
2020
Tesis de maestría
Español
GENÉTICA DE POBLACIONES
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Appears in Collections:Tesis de Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales

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