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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/1868| Genómica poblacional de la sardina monterrey Sardinops sagax (Jenyns, 1842) en la costa oeste de la Península de Baja California y el Golfo de California | |
| CECILIA JUDITH HID CORONEL | |
| JUAN ANTONIO DE ANDA MONTAÑEZ Fausto Valenzuela Quiñonez | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| genómica poblacional, SNPs, dd-RAD, Sardinops sagax population genomics, fisheries | |
| "El manejo de los recursos pesqueros requiere la identificación de las poblaciones (stocks) y su distribución espacial. Sin embargo, los métodos tradicionales de identificación de stock, normalmente no consideran la estructura genética poblacional, ni la potencial influencia de la selección natural como factor para generar adaptaciones locales. No obstante, la amalgama de poblaciones y grupos con adaptación local (biocomplejidad), determina la capacidad de resiliencia y prevalencia de los recursos marinos. La sardina monterrey (Sardinops sagax) se distribuye a lo largo de la Corriente de California y dentro del Golfo de California, y es parte de la pesquería de pelágicos menores, la cual es llevada a cabo en la costa occidental de la Península de Baja California (PBC) y en el Golfo de California (GC). La pesquería de pelágicos menores es la más relevante a nivel nacional en términos de volumen. Diversas aproximaciones derivan en hipótesis con la presencia de entre una (genética) a tres (fenotipos) poblaciones de sardina monterrey en la región, lo que genera incertidumbre del número de stocks. El presente estudio tuvo como objetivo identificar su estructura genómica poblacional considerando los grupos con potencial adaptación local. Se colectaron 139 muestras provenientes de las tres localidades (Ensenada, Bahía Magdalena y Guaymas), y se llevó a cabo el análisis de su estructura neutral y adaptativa. En total, se obtuvieron 5,166 marcadores tipo SNPs, de los cuales 4,881 fueron loci neutrales y 8 se consideraron loci candidatos a selección (outliers). El análisis de los marcadores neutrales indica una estructura de tipo panmixia, mientras que el estudio de marcadores outliers sugiere la existencia de dos grupos con adaptación local, uno en la costa occidental de la PBC y el otro dentro del GC. Esto indica que la hipótesis prevaleciente de tres stocks es resultado del efecto de la plasticidad fenotípica. Asimismo, se brindan elementos para ser considerados por los administrados en el plan de manejo del recurso." "Fisheries management requires the accurate identification of populations (stocks) and its spatial distribution. However, traditional methods in stock identification don’t consider population genetic structure and the potential influence of natural selection to promote local adaptation. Although, the amalgam of populations and local adapted groups (biocomplexity) determines the resilience capacity and prevalence. The monterrey sardine (Sardinops sagax) inhabits along the California Current and the Gulf of California. It is part of the small pelagics fishery, performed at the west coast of the Baja California Peninsula (BCP) in the Gulf of California (GC). The small pelagic fishery represent the most important fishery by catch volume in Mexico. There are several hypothesis of the number of populations of monterrey sardine from one (genetic) to three (phenotypic) raising concern about the real stock composition. The aim of this study was to determine the genomic population structure considering groups with potential local adaptation. Samples (139 organisms) were used from three localities (Ensenada, Bahía Magdalena and Guaymas) for neutral and adaptive population structure analysis. A total of 5,166 SNPs markers were obtained, of which 4,881 were considered as neutral loci and eight as candidate adaptive loci (outliers). Neutral markers obtained suggested a panmictic population structure, while the study of outliers markers suggest the existence of two groups with local adaptation, one in the west coast of the BCP and other one inside the GC. Results indicate that the prevailing hypothesis of three stocks is result of phenotypic plasticity rather than population structure. Furthermore, this research give insights to be considered for stakeholders in the management plan of the fishery. " | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. | |
| 2020 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| DINÁMICA DE LAS POBLACIONES | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| hid_c TESIS.pdf | Tesis de Cecilia Judith Hid Coronel | 1.04 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |