Please use this identifier to cite or link to this item: http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/1622
Paisaje marino genómico del gobio Lythrypnus dalli (Gilbert 1890) en el Golfo de California
CAMILA MAC LOUGHLIN ALEMAN
Fausto Valenzuela Quiñonez
Eduardo Francisco Balart Páez
Acceso Abierto
Atribución-NoComercial-SinDerivadas
genómica del paisaje, conectividad, adaptación, ddRAD, Lythrypnus dalli
seascape genomics, connectivity, adaptation
"La genómica del paisaje marino se enfoca en relacionar la estructura genética espaciotemporal a características del paisaje, como patrones de conectividad y gradientes ambientales. Un creciente número de evidencias ha puesto en duda el paradigma de homogeneidad genética en especies marinas, con fuertes implicaciones sobre las estrategias de manejo y conservación actuales. El Golfo de California (GC) posee complejos patrones oceanográficos y gran variabilidad ambiental, por lo que ofrece oportunidades únicas para probar hipótesis acerca del efecto de los factores que moldean la diversidad y estructura genética. El modelo de estudio es el gobio Lythrypnus dalli, pez criptobéntico de hábitats rocosos y coralinos. Posterior a su fase larval móvil presentan gran fidelidad al sitio, y su distribución geográfica atraviesa condiciones ambientales muy heterogéneas, por lo que sería esperable encontrar poblaciones con adaptaciones locales. El objetivo del presente trabajo es determinar la influencia de la distancia geográfica u oceanográfica sobre la estructura genómica neutral, y la influencia de la heterogeneidad ambiental sobre los patrones de diversidad adaptativa de L. dalli en el GC. Para ello, se colectaron individuos mediante buceo en 7 localidades de la costa occidental del GC, se obtuvieron patrones de estructura neutral (1,261 SNPs) y adaptativa (13 SNPs) a partir de librerías genómicas (ddRAD), y se compararon contra patrones de conectividad (derivados de simulaciones basadas en el flujo de corrientes del GC), temperatura superficial y clorofila-a (obtenidos de imágenes satelitales). La estructura genómica neutral indicó panmixia. No obstante, se detectó variación en los niveles de parentesco entre sitios y un patrón de aislamiento por distancia oceanográfica. En conjunto, los resultados sugieren una estructura metapoblacional con niveles sustanciales de conectividad, en la cual localidades norteñas fungen como fuentes de migrantes hacia el centro y sur del GC, de acuerdo a las corrientes predominantes durante la primavera. La búsqueda de patrones de diversidad adaptativa, en cambio, no fue posible debido a la cantidad y calidad de marcadores relacionados a procesos selectivos detectados. Esto se debe posiblemente a la baja cobertura genómica y espacial obtenida. Estos resultados proveen un aporte para refinar las estrategias de manejo y conservación de la biodiversidad en el GC."
"Seascape genomics focuses on the relationship between spatiotemporal patterns of genetic structure and seascape features, like ocean currents and environmental gradients. An increasing number of evidences have recently challenged the genetic homogeneity paradigm in marine species, with strong implications to current management and conservation policies. The Gulf of California (GC) encompasses complex oceanographic currents and strong asymmetrical flow, in addition to high environmental heterogeneity, resulting in unique opportunities to test hypotheses about determinants of neutral and adaptive genetic structure patterns. Our model species was the small blue-banded goby Lythrypnus dalli, a small crypto-benthic reef fish. After a mobile larval phase, they have great site fidelity and a wide distribution throughout heterogeneous environmental conditions, which might allow local adaptations to occur. Our main objective is to determine the relative contribution of geographic or oceanographic distance over the neutral genetic structure, and the contribution of environmental heterogeneity over the adaptive genetic structure of L. dalli in the GC. Samples were collected from 7 sites in the GC, neutral (1,261 SNPs) and adaptive (13 SNPs) spatial structures were obtained from genomic libraries (ddRAD). Population structure was correlated to oceanographic connectivity hypotheses based on current flow, and environmental factors (temperature and chlorophyll) as predictors. Neutral genomic pattern indicates panmixia. However, variable relatedness levels and isolation by oceanographic distance were also detected. Overall, results point out to a metapopulation genetic structure with substantial connectivity, in which northernmost sites act as sources of migrants towards central and southern locations, according to predominant current flow during spring in the peninsular coast of the GC. The search for adaptive genomic patterns was limited given the amount and quality of detected candidates for selection, probably due to the low genomic and spatial coverage. This results help refine management and conservation strategies to maintain biodiversity in the GC."
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
2019-07
Tesis de maestría
Español
OCEANOGRAFÍA BIOLÓGICA
Versión aceptada
acceptedVersion - Versión aceptada
Appears in Collections:Tesis de Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales

Upload archives


File Description SizeFormat 
mac-loughlin_c TESIS.pdfTesis de Camila Mac Loughlin Aleman2.6 MBAdobe PDFView/Open