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http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/1903| IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE Cucurbit leaf crumple virus (CuLCrV); UN BEGOMOVIRUS BIPARTITA ASOCIADO AL MELÓN DE BAJA CALIFORNIA SUR | |
| JESUS RICARDO HERNANDEZ BARRERA | |
| RAMON JAIME HOLGUIN PEÑA | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| recombinación, begomovirus bipartita, primer reporte, ORF´s, CuLCrV-BCS recombination, bipartite begomovirus | |
| "El melón (Cucumis melo L.), perteneciente a la familia de las cucurbitáceas, es un cultivo con un importante valor comercial, ocupando Baja California Sur (BCS), el décimo lugar nacional en su producción. Lo anterior, se ve afectado por diversas enfermedades en el cultivo, de tipo viral. En el ejido de El Pescadero, BCS, se han observado síntomas de clorosis, rugosidad y enchinamiento de hojas, presuntivamente relacionados a una infección begomoviral en hojas de melón. En el presente trabajo se identificó al agente causal de la enfermedad presentada en el melón; Cucurbit leaf crumple virus (CuLCrV). Además, se realizó la caracterización molecular del virus para dilucidar posibles relaciones filogenéticas y de recombinación con otros begomovirus de BCS. La secuencia completa del componente A del CuLCrV aislado en BCS (CuLCrV-BCS), obtuvo el mayor porcentaje de identidad nucleotídica (>92%) con el CuLCrV de Arizona, USA (AF256200.4). De acuerdo a lo anterior, y con base en los criterios de identidad del ICTV (>91% y <94%); CuLCrV-BCS, podría ser considerada una nueva variante del CuLCrV. Los marcos de lectura abierto (ORF´s), de los cinco genes identificados y tipificados para CuLCrV-BCS (AV1, AC1, AC2, AC3 y AC4), correspondieron correctamente a la organización genética típica de un begomovirus bipartita. Se identificaron 21 sitios únicos de corte enzimático para CuLCrV-BCS, con algunos específicos (SspI, ApaI, ClaI Y Sall) relacionados con los ORF´s. El análisis filogenético confirmó que el CuLCrV es el ancestro más cercano del CuLCrV-BCS, pero también mostró una estrecha relación filogeográfica con él Squash leaf curl virus (SLCuV) (MF187211); un begomovirus reportado previamente en BCS, México. Con el análisis de recombinación se identificó una homología genómica en la región conformada entre los 800 y 1800 pb del genoma A del CuLCrV-BCS, y los ORF´s AC2 y AC3 del SLCuV (MF187211). Los resultados obtenidos de esta investigación contribuyen en la generación del primer reporte de infección por CuLCrV en BCS. " "Melon (Cucumis meloL.), belonging to the cucurbit family, is a crop with an important commercial value, occupying Baja California Sur (BCS), the tenth national place in production. However, one of the main diseases that affect the crop is viral type diseases. In the El Pescadero area, symptoms of chlorosis, leaf curl and crumpling have been observed and presumably related to begomoviral infections in melon leaves. In the present work, the causal agent of the disease in infected crop plants was identified as Cucurbit leaf crumple virus (CuLCrV). Moreover, a molecular characterization was performed to elucidate possible phylogenetic and recombination relationships of CuLCrV with other BCS bipartite begomoviruses. The complete sequence of component A of CuLCrV isolated in BCS (CuLCrV-BCS), had the highest percentage of nucleotide identity (>92%) with the CuLCrV from Arizona, USA (AF256200.4). According to the above, and based on the ICTV identity criteria (>91% and <94%); CuLCrV-BCS, could be considered a new variant of CuLCrV. The open reading frames (ORFs) of the five genes identified and typed for CuLCrV-BCS (AV1, AC1, AC2, AC3 and AC4), corresponded to the typical gene organization of bipartite begomovirus. Twenty-one unique enzymatic cleavage sites were identified for CuLCrV-BCS, with some specific (Sspl, ApaI, Clal and Sall) related to the ORFs. Phylogenetic analysis confirmed that CuLCrV is the closest ancestor of CuLCrV-BCS, although with close phylogeographic relationship to Squash leaf curl virus(SLCuV) (MF187211); a begomovirus previously reported in BCS, Mexico. With the recombination analysis and genomic homology was identified in the region formed between 800 and 1800 bp of the CuLCrV-BCS genome A, and the SLCuV AC2 and AC3 ORFs (MF187211). The results obtained from this research contribute to the generation of the first report of CuLCrV infection in BCS." | |
| Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. | |
| 2020 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| FITOPATOLOGÍA | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales |
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| hernandez_j TESIS.pdf | Tesis de Jesús Ricardo Hernández Barrera | 3.07 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |